Latar Belakang: Keamanan data RME merupakan aspek penting dalam penyelenggaraan pelayanan kesehatan, terutama dalam menjaga keamanan data pasien. Keamanan data berarti memastikan bahwa data dalam sistem tidak dapat dilihat atau diubah oleh orang-orang yang tidak berwenang. Semua pemilik dan pengelola sistem informasi harus memastikan bahwa data yang disimpan aman dan hanya dapat diakses oleh pihak yang berwenang. RS Bethesda telah menerapkan RME sejak tahun 2010. Pengukuran tingkat keamanan data RME ini berdasarkan aspek confidentiality (kerahasiaan), integrity (integritas), dan availability (ketersediaan). Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat keamanan data RME di RS Bethesda Yogyakarta berdasarkan aspek confidentiality (kerahasiaan), integrity (integritas), dan availability (ketersediaan). Metode: Metode penelitian yang digunakan adalah deskriptif kuantitatif. Sampel diambil dari 612 petugas pengguna RME dengan menggunakan teknik purposive sampling didapatkan 86 petugas. Pengumpulan data dilakukan menggunakan kuesioner, kemudian dianalisis secara deskriptif menggunakan Microsoft Excel dan SPSS 22 For Windows dalam bentuk persentase. Hasil: Hasil penelitian menunjukkan bahwa tingkat keamanan RME Di RS Bethesda Yogyakarta berdasarkan pada aspek confidentiality memperoleh nilai rata-rata sebesar 83% dengan kategori sangat baik, aspek integrity sebesar 87% dengan kategori sangat baik, dan aspek availability sebesar 83% dengan kategori sangat baik. Kesimpulan: Tingkat keamanan data rekam medis elektronik di RS Bethesda Yogyakarta secara keseluruhan berada pada kategori sangat baik.