Latar Belakang: Pemeliharaan dokumen yaitu suatu upaya yang dilakukan untuk melindungi dari kerusakan fisik dan informasi yang terdapat di dalam rekam medis tersebut. Jika pemeliharaan dokumen rekam medis tidak dilakukan, maka dokumen akan mengalami kerusakan. Oleh karena itu, penting untuk menjaga dokumen agar tetap berkualitas dan tidak mengalami kerusakan pada tempat penyimpanan. Tujuan: Diketahuinya pelaksanaan sistem pemeliharaan dokumen rekam medis di ruang filing Puskesmas Wirobrajan Yogyakarta. Metode Penelitian: menggunakan deskriptif kualitatif dengan desain cross sectional. Subjek penelitian yaitu kepala rekam medis dan 2 petugas filing. Objek penelitian yaitu ruang filing dan dokumen rekam medis. Teknik pengumpulan data menggunakan observasi,wawancara dan studi dokumentasi. Instrumen yang digunakan yaitu pedoman observasi (check list), pedoman wawancara dan alat pengukur suhu. Analisis data menggunakan reduksi data, penyajian data dan penarikan kesimpulan. Hasil: Pemeliharaan dokumen secara fisik sudah menggunakan 1 buah AC, penerangan menggunakan 1 lampu dengan daya 20 watt, ventilasi cukup, memiliki 1 buah APAR, tempat penyimpanan 1 roll o pack, penggunaan bahan�bahan pencegah kerusakan hanya menggunakan kapur barus, belum terdapat tata tertib, kebersihan ruang filing menggunakan sapu. Faktor intrinsik bahan penggunaan kertas yang baik dan tinta yang tidak mudah luntur, faktor ekstrinsik masih ditemukan permasalahan belum ada pelindung dokumen rekam medis sehingga sirkulasi udara dapat merusak kertas. Belum ada upaya pencegahan menggunakan fumigasi, restorasi arsip dan microfilm. Kesimpulan: Pelaksanaan pemeliharaan dokumen masih ditemukan dokumen rekam medis pasien baru tanpa pelindung map/ cover, kelembaban di ruang filing tinggi karena AC tidak menyala selama 24 jam, kurangnya penerangan. Upaya pencegahan dokumen di ruang filing hanya menggunakan AC. Belum adanya SOP mengenai pelaksanaan sistem pemeliharaan dokumen rekam medis. Kata Kunci: Pemeliharaan, Dokumen Rekam Medis, Ruang Filing